大连海事大学与深圳联合国际船舶代理有限公司联手建立的深圳研究院，于2007年3月18日正式揭牌。

大连海事大学深圳研究院发展原则是依托学校本部的学科优势和基础，面向深圳市的经济环境和航运、物流需求，发展前沿学科与新兴学科。这个研究院突破区域办学的限制，利用深圳市良好的港口环境和经济环境，探索新的办学思想和办学模式，开拓新的科研领域，在该校与“珠三角”区域之间创造出一条培养新型应用人才和科技开发、科技成果转化的快速通道。打造泛珠江三角洲乃至全国具有航运行业特色的高级人才培养和科研基地，为港航物流业输送具有国际视野、创新思维和开拓精神以及良好职业道德的高素质复合型管理人才，为航运业发展战略决策研究与咨询等重大决策提供技术支持及科技服务。

研究院计划面向社会，走市场化、社会化和国际化道路，开设高级航运管理硕士班、工商管理硕士班（MBA）、法律硕士班(J.M)、公共管理硕士班（MPA）、工程硕士班、研究生进修班等。