吴明卫，毕业于安徽省合肥市中国科大附中，1986年考入中国科学技术大学近代物理系，1990年获得郭沫若奖学金，1991年获得学士学位。同年，吴明卫继续在科大就读研究生，1995年获得凝聚态物理博士学位。吴明卫的父亲是中国科学院院士、中国科大教授吴杭生先生。

博士毕业后，吴明卫曾在美国Stevens理工学院、美国Rochester大学、德国法兰克福大学理论物理研究所、美国加州大学圣巴巴拉分校从事博士后研究。2001年2月至2001年12月担任日本东京大学研究员。

吴明卫博士自2000年11月至今担任中国科大教授，2002年8月起任西藏大学数理系客座教授，2003年2月至4月曾赴美国Delaware大学访问。2004年至今担任合肥微尺度物质科学国家实验室首席研究员。此外，吴明卫教授是中科院“百人计划”资助者，国家杰出青年基金获得者。

微尺度国家实验室及物理系吴明卫教授近期接受荷兰Elsevier出版社邀请，担任Physica E: LOW-DIMENSIONAL SYSTEMS AND NANOSTRUCTURES杂志的编辑，任期从2008年4月开始。

Physica E是低维系统及纳米结构的专业杂志，主要发表半导体异质结构、量子阱和超晶格、二维电子系统、量子线和量子点等方面的基础和应用研究文章。