乌鲁木齐市卫生监督所，是根据《中共中央，国务院关于卫生改革与发展的决定》和卫生部《卫生监督体制改革的意见》精神，经市人民政府研究决定，由市编委批准（乌编委〔2003〕14号）于2004年3月17日正式成立。

乌鲁木齐市卫生监督所是市卫生局依法行使卫生监督执法的执行机构。定编74人，下设8个行政、业务科室。具体依法承担《食品卫生法》、《传染病防治法》、《职业病防治法》等卫生法律、法规和规章规定的卫生监督执法职能。

主要任务是：负责全市传染病防治、职业病防治、食品卫生、生活饮用水卫生、化妆品卫生、公共场所卫生、学校卫生、碘盐管理等八类监督执法任务；开展健康相关产品抽检工作，受理违法案件的投诉、举报,并调查处理；开展卫生法律、法规宣传、咨询和培训工作。

目前，所现有工作人员74人，其中党员18名，经2004年5月13日全体党员大会表决通过，成立了所党支部。