四川省微生物学会成立于1982年10月，挂靠在成都生物制品研究所，办事机构设在成都生物制品研究所。学会下设农业微生物学（办事机构设在四川农业大学）、工业微生物学（办事机构设在中科院成都生物研究所）、医学微生物学（办事机构设在四川大学华西医学中心）、畜牧兽医微生物学（办事机构设在成都药械厂）、基础微生物学（办事机构设在四川大学生命科学院）5个专业委员会。现有理事32人（第五届）、名誉理事1人。学会拥有四川省微生物学专业领域老中青知名专家。目前共有会员500名，分布于四川省28个市地州县114个单位。

学会在国家改革和科技经济发展中不断发展。本会立足自身优势和特点，在两个文明建设服务中，树立科技兴国战略思想，坚持发挥学会基本属性和社会职能，密切联系全省科技工作者，加强学术交流活动。学会每2年召开一次全省学术年会（规模80-100人），通过会议展示四川省微生物学工作者的科技成果，提供培养和发现青年科技人才的舞台，促进工业、农业、医学、畜牧兽医微生物学等专业在行业的技术进步，研究提出微生物学领域研究中的可持续发展计划，并尽力与经济建设、决策咨询、生产活动结合起来。

我会成立以来举办过大型学术活动11次，召开多形式小型学术活动100多次，评选优秀论文300多篇，交流论文约1500篇。学会举办的青年学术交流会和召开各届会员代表大会，均受到了全省微生物学工作者的广泛关注和参与，涌现了一批青年科技工作者，展示出我省微生物学事业高层次的学术水平和欣欣向荣景象。20年来，学会在中国微生物学会和四川省科协的指导下，在挂靠单位的支持资助下，通过全省广大会员的共同努力，在专业领域中开展了大量工作，为四川省经济建设和科技发展做出了贡献。

学会对历年来在学会工作做出无私贡献的、因身体或工作原因不再担任学会理事的同志给予高度评价，并颁发了荣誉证书以示尊重。

1998年重庆成为直辖市后，学会与重庆学会进行了工作交接，在召开庆祝本会成立十五周年的大型学术会议中，对重庆市会员与学会成立走过的风雨历程以及在学会工作中所作的贡献给予了充分的肯定。学会于2001年11月15-18日在成都召开了第五届会员代表大会暨第十一次学术年会，会议选举产生了第五届理事会。推选出杨洪举为理事长。