深部地质填图（deep geological mapping）是在地面以下一定深度（一般可到莫霍面），应用各种物探、钻探等勘查技术，获取地下深部地质信息的填图工作。一般安排在与已知重要成矿地区相邻但被第四系或较新沉积物覆盖而有成矿远景的地区中，对控矿的深部地质构造进行地质填图。该项填图工作的比例尺以1︰5万、1︰20万为主。进行该项工作时首先选择地质情况能代表全区且露头较好地段，垂直主要构造线方向进行地质、物探、化探综合标准剖面图的测制，用做解译覆盖地区其他平行剖面的依据。此外，还采用钻探以验证及修改所解译的剖面，中比例尺平均10～15平方千米一个钻孔，大比例尺每2平方千米一个钻孔。