上海水生生物科技馆是上海市水生生物科普教育基地的重要组成部分，展出了各类代表性水生生物1000余种，包括被誉为“海中大熊猫”的中华白海豚、作为物种定名依据的模式标本等大量珍贵标本。通过艺术的设计和现代的水环境声像营造系统，围绕“人类与水世界和谐共处”这一主题，集中表现了丰富的水生生物世界。

本馆基本陈列包括：和谐的水世界、生物的演化历程、绚丽多彩的藻类、湿地景观模拟、千奇百怪的无脊椎动物、江河湖海的主宰——鱼类、丰富多彩的长江鱼类、餐桌上的常客、空间立体幻影叠像、科学人文、科技成果、模式标本、大自然的警钟等展区。展示新颖别致，是科学、艺术与高科技的有机结合，是人类认识水世界、了解生物多样性的一个重要窗口。