山西医科大学图书馆成立于1919年，为了适应图书馆现代化发展的需要，2005年，图书馆进行了大规模的馆舍改造与布局调整。目前，图书馆拥有馆舍面积8766.46平方米，设各类阅览室11个，中外文书库6个，电子阅览室2个，阅览座位1014个。 截止到2006年8月，图书馆藏书量达140余万册，其中包括印刷型图书84余万册，期刊合订本12余万册，电子图书38余万册，光盘及网络数据库30余种。

图书馆设有一室（办公室）、五部（图书部、期刊部、技术部、计算机部、信息咨询部） 、一个专业（医学信息管理专业）。图书馆现有正式职工47名，具有硕士学位的15人(4人在读)，占总人数的32%；本科生20人，占总人数的43%。图书馆人员职称结构为：高级专业技术职务6人，中级专业技术职务17人。

图书馆的自动化建设从1996年开始起步，采编、流通和期刊管理等方面较早运用计算机。2004年，图书馆购进北邮图书馆集成管理系统，实现了采访、编目、流通、期刊管理、公共检索等主要业务环节的管理和服务自动化。目前，拥有220台电脑和服务器集群组成的网络系统，自动化网络服务系统24小时开放，校园网内的读者可以随时进行本馆书目、光盘及网络数据库等电子资源的查询。

承担了山西省科技厅、高校人文社科资助和省教育厅教学改革所立项的“山西省医学科技文献信息资源服务平台”、“山西省医学高等教育文献信息保障体系”、“网络信息资源评估体系的研究与应用”、“山西省高校生物医学院电子信息资源调查分析”、“医学信息检索分层次教学体系的实践研究”、“地方医学院校医学信息管理专业医学信息检索课程的教学模式的改革与实践”等多个项目的建设，主编与参编教材19部，其中国家统编教材8部，规划教材1部。在国内学术刊物上发表专业学术论文近百篇，多次获得国家及省级奖励。