动物生物工程与疾病防治实验室依托山东农业大学，下设动物胚胎工程与种质创新利用、动物疾病防治、动物营养生理和蚕业工程技术四个研究方向。

1、动物胚胎工程与种质资源创新利用：主要从事动物胚胎发育生物学、高效胚胎工程产业化技术、分子育种原理与技术、现代动物育种理论与技术和动物种质资源保护与开发利用理论与技术等方面的研究，在动物胚胎工程、动物克隆技术方面的多项研究居国内领先地位，在分子育种、数量遗传、畜禽新品种（系）选育等方面具有较强研究实力。

2、动物疾病防治研究方向：主要从事分子病原学、分子免疫学、分子病理学、动物传染病诊断与防治等方面的研究，在禽免疫抑制性和肿瘤性病毒研究方面的多项研究工作居国内领先水平，在畜禽传染性疾病病源学与诊治技术、病源气溶胶传播规律、生物制剂等方面具有较强的研究实力。 3、动物营养生理研究方向：主要从事分子营养学、物质代谢动力学、环境营养学、动物营养工程技术等方面的研究，在家禽营养生理、家禽环境营养、反刍动物营养生理等方面的多项研究工作居国内领先水平，在主要畜禽营养需要量、饲料营养价值评定、饲料加工等方面具有较强研究实力。 4、蚕蜂工程技术研究方向：主要从事蚕蜂病理与疾病防治、蚕蜂生理与养殖新技术、蚕蜂蚕桑种质资源开发利用、基于蚕蜂的生物制品与功能制品开发技术等方面的研究，在家蚕育种、蚕病防治、家蚕摄氏行为等方面的多项研究居国内领先地位，在蚕、蜂分子生物学及产业化工程技术等方面具有较强的研究实力。 本实验室建设是我省畜牧兽医科学研究的重大基础工程，建设的总体目标是以生物技术和信息技术应用为重点，形成我省畜牧兽医基础科学理论和重大高新技术创新的源头高地，为发展我省的现代畜禽育种产业、现代动物生物工程产业和发展现代畜牧生产技术、现代兽医技术，建立安全、优质、循环的可持续现代畜牧生产系统提供源头创新支撑。