器质性不孕是指生殖器的病理解剖变化引起的不孕，如生殖系统炎症、肿瘤、畸形等。我国古代所说的“五不女”、“五不男”就属于这个范畴。民间所说的“石女”、“阴阳人”也属于这一类。

“五不女”是指“螺、纹、鼓、角、脉”。“螺”是指阴道中有螺旋纹，妨碍性生活。“纹”即纹阴，类似于先天性阴道狭窄者。“鼓”即鼓花，指阴道绷紧似无孔，类似于先天性无阴道或处女膜闭锁；“角”即角花，类似于阴蒂过长、畸形，部分可能是阴阳人（两性畸形）；“脉”是指月经不调甚至闭经，类似于先天性性腺发育不良。“五不男，”是指 “天、漏、犍、怯、变”，“天”是指男性因先天性外生殖器和睾丸缺陷或发育异常而不能生育者。“漏”是指精关不固，早泄、遗精过多导致精液质量下降影响生育者，多属功能性。“犍”是指阴茎及睾丸切除者。“怯”是指阳痿不举。“变”是指两性畸形。