为加强农机安全管理，农业部于1999年6月8日成立了农机监理总站（在农机推广总站加挂农机监理总站牌子）。农机监理总站的主要职能是：组织农机安全生产检查；承担农机安全技术检验标准、驾驶（操作）人员考试办法、农机安全作业规程等监理法规的研究、起草和论证工作；承担农机事故统计分析，提出防范措施，协助地方处理重、特大农机事故；组织开发农机监理装备，推广农机监理所需的仪器、设施和设备；组织编写农机安全宣传材料和农机监理人员培训教材；开展农机监理人员培训与业务交流活动；承担农机监理计算机软件开发和组织农机监理信息网络建设工作；承担农业机械化管理司交办的其他农机安全监理工作。

截至2005年底，全国县以上农机安全监理机构有2955个，有农机安全监理人员共3.6万人，乡镇农机安全协管人员6万余人。