1859年的11月24日，达尔文出了本书叫《论物种起源：通过自然选择的方式》。他的主要观点是：各物种缓慢演变，物竞天择，适者生存。他虽然没有明确说出“人是猴子变的”，但书中处处充满这样的暗示。在146年前，这对英国人的刺激程度相当于1945年原子弹对日本人的刺激。当时人们普遍迷信两个凡是：凡是《圣经》说的都对，凡是不符合《圣经》的都错。而《圣经》上说：物种是上帝创造的，而且是永恒不变的。赫胥黎则是坚决支持达尔文观点的人之一。1860年6月30日，赫胥黎与牛津主教威尔伯福展开了一场短兵相接的论战。威尔伯福以讽刺的口吻问赫胥黎：“请问与猴子发生关系的是你祖父那方还是祖母那方？”这刻薄的词句引擎人们的喧哗。但赫胥黎却从容走上讲台，以确凿的事实反驳了牛津大主教的话，并说：“一个人并没有理由因为猴子做他的祖父而感到羞耻，真正感到羞耻的应该是那些逍遥用花言巧语和宗教情绪将真理掩蔽的人，然而，这永远是做不到的！”这便是著名的牛津大论战。

最终，经历了曲折的斗争，达尔文进化论终于在生物学领域取得了胜利，使生命科学完全建立在唯物主义的基础之上，赶走了上帝的统治，改变了人们的宇宙观，这是人类进化进程的又一个光辉的里程碑。