南通大学体育科学学院现有体育教育训练学硕士学位点，有体育教育和社会体育两个本科专业。两次被江苏省教育厅授予体育工作先进单位等荣誉称号。体育教育专业先后被评选为江苏省体育教育教改试点专业、江苏省特色专业和江苏省品牌专业。体育科学学院还是中国大学生体育协会舞龙舞狮分会训练基地。学院现有全日制本科生近500人，本、专科函授生400余人。

体育科学学院现任教师中有教授5人，副教授34人，博、硕士研究生23人。教师中有26人具有国家级和一级裁判员资格。教师中有多人受到教育部、江苏省人民政府、江苏省教育厅、南通市人民政府的表彰和奖励，多人被评为全国高等学校优秀青年体育教师、江苏省“333工程”培养对象、江苏省高等学校“青蓝工程”中青年学术带头人培养对象、江苏省优秀教育工作者、江苏省优秀青年骨干教师、“南通市跨世纪学术带头人”、“南通市专业技术拔尖人才”等荣誉称号。

近年来，教师共主持研究市厅级以上课题16项；发表论文540余篇，其中核心期刊70余篇；出版专著、编著和主编教材等34部。26项成果获教育部和江苏省科研成果二等奖、江苏省高等教育教学成果一、二等奖等奖项。

学院积极贯彻《学校体育工作条例》和《全民健身计划纲要》，组织开展丰富多彩的课余体育健身活动与比赛，做到月月有赛事，形成了独特的校园体育文化。学校设有高水平运动队，在全国比赛和江苏省大学生运动会等多项比赛中获得多次冠军、亚军等优异成绩。并有运动员代表国家队参加了雅典奥运会比赛，现正在积极备战2008年北京奥运会。

学校拥有比较完善的体育设施。现有体育馆、游泳池、体操馆、乒乓房、健身房、健美操房等室内场馆；有中国田径协会检验合格的标准400米塑胶田径场4片和300米塑胶田径场1片；有网球场、篮球场和排球场等近100片室外运动场地等。