2012年3月20日零点，沪宁高铁起启用新时刻表，按照日常和周末（周五至周日）两种开行模式进行了重新安排。沪宁城际高铁周末车次增加，首班列车发车时刻提前，沿途停靠车站均衡安排。上海末班高铁列车提前52分钟，到杭州提前2小时14分。

“3·20”调图后，沪宁线南京至上海（虹桥）间日常（周一至周五）开行高铁列车60对，其中南京至上海38对、南京南至上海2对，南京至虹桥15对，南京至杭州5对。周末（周五至周日）增加高铁列车4对。