横琴出入境边防检查站坐落在连接珠澳两地的莲花大桥旁的国家一类口岸--横琴口岸，位于珠海横琴经济开发区内，与澳门路环岛一桥之隔，隔海相望。2000年3月28日经国务院批准，横琴口岸正式对外开放。口岸现设出入境边防检查通道共24条，其中货车入出境通道各3条，客车入出境通道各2条，旅客出境通道8条,入境通道6条。横琴口岸通关时间为：8：00--20：00，其中旅客和客运车辆为9：00--20：00。

横琴出入境边防检查站为正处级建制，隶属珠海出入境边防检查总站。主要任务是担负过往横琴口岸旅客、员工及车辆的出入境检查工作和对莲花大桥进行24小时警戒监护。

在公安部六局和珠海总站党委的正确领导下，横琴站党委带领全站民警，牢固树立"立警为公、执政为民"思想，团结协作，克服种种困难，奋发图强，坚持以边检执勤为中心，狠抓队伍思想建设和行政管理，加大后勤保障力度，内强素质、外树形象，以崭新的精神风貌和优质、高效的工作姿态取得了可喜的成绩，赢得了部局和总站的肯定和旅客的好评。2004年截至七月二十日止，横琴站验放出入境旅客数量达1030775人次，查验出入境车辆321571辆次，分别比去年同期增长79.4％和34.6％，旅客、车辆出入境流量逐年攀升，横琴口岸已成为珠海第二大口岸。现今来往珠海、澳门两地的全部货运车辆都从横琴口岸出入境，绝大多数台胞也选择从横琴口岸来往内地与台湾，横琴口岸已成为珠澳两地的物流生命线和旅客出入境的快捷通道。

横琴站建站以来获得各类荣誉称号及立功受奖的集体和个人层出不穷，其中站属六队荣获公安部直属机关"青年文明号"荣誉称号、连续三年荣立集体三等功、四次被评为总站"先进党支部"、2004年荣获珠海市直工委固本强基工程先进党支部称号。民警荣获部局"2000年度优秀检查员"称号1人、"优秀共产党员"称号3人，30余人次荣获部局、珠海市直工委、总站党委优秀共产党员、优秀党务工作者称号，16人次荣立个人三等功，70多人次受到珠海总站嘉奖。