河南省农业科学院经济作物研究所的前身是河南省农林科学院作物研究所，始建于1958年，1979年分设增建河南省农科院经济作物研究所，2000年由河南省农科院经济作物研究所与河南省芝麻研究中心合并组建河南省农业科学院棉花油料作物研究所。

现有在职职工78人,其中高级22人,中级21人,初级8人；先后有18人享受国务院特殊津贴,2人获国家有突出贡献中青年专家称号,9人获河南省优秀专家称号,拥有博士、硕士17人。

该所主要从事棉花、大豆、花生、油菜、芝麻等作物的遗传育种、栽培生理生化和品种利用等科学研究工作，是河南省和国家棉花与油料作物育种攻关的骨干单位，在短季棉、抗病棉花育种，高产夏大豆育种，优质油菜育种，高产花生育种和芝麻杂交种等领域居全国同行的先进水平。1981年以来育成棉花油料作物新品种60多个，其中25个通过国家审定，科技成果覆盖整个黄淮地区和新疆棉区，先后有60多项科技成果获省（部）以上成果奖，其中16项获国家重大科技成果奖和发明专利。1991、1996年分别被评为“七五”、“八五”全国农业科研、开发综合实力百强单位。

十多年来我所先后与比利时、法国、印度、日本等国建立了多种形式的长期友好交流与合作关系。还派去多名科技人员不断到国外参加学术交流活动或相关的研究工作。同时还接待了比利时、法国、日本、越南等外国专家学者到所进行学术交流与技术考察。

“十五”承担国家跨越计划2项、863计划3项、863重大专项1项、国家农业科技成果转化资金7项、国家农业结构调整重大专项1项、国家科技攻关项目4项、农业部发展棉花生产专项基金4项、省攻关重大项目1项、省攻关重点项目3项、省杰出人才创新基金1项、省杰出青年科学基金3项，等共50余项。目前，全所职工正以高昂的姿态跨入二十一世纪，力争为振兴河南乃至全国农村经济做出新的贡献。