海南大学经济研究所前身是成立于1997年的中国现代经济理论研究所。2010年，研究所更名为经济研究所，标志着研究所探索更广阔经济领域的开端。

研究所拥有一支教学经验丰富，学术造诣较高师资团队，其中教授6人，副教授3人。研究所设有政治经济学硕士点，拥有硕士研究生15人。

目前，研究所设有两大研究领域：中国现代经济理论论和市场经济理论。

其中，中国现代经济理论的研究在首任所长王毅武教授的带领下，历经十多年的建立、推进与完善。先后出版学术著作20多部（其中高校教材9部）、发表学术论文60多篇，获得各种奖励10多项，完成国家及省部级课题8项，多次参加国内该领域高层次的学术会议并在多个城市与高校讲学或讲座，不但提高了海南大学的知名度和影响力，而且获得广泛好评。中国经济思想史学界已确认“中国现代经济理论”在该学术研究领域的地位，并认定其为新的分支学科。2004年“中国现代经济理论”含在“政治经济学”内获批海南省省级重点学科。

市场经济理论的研究在现任所长李仁君教授的带领下，出版著作10部，发表论文116篇，完成国家课题1项，主持中国博士后科学基金课题2项，主持教育部人文社会科学研究一般项目2项，中国博士后科学基金课题1项，主持并完成省级课题5项。主讲课程《微观观经济学》和《宏观经济学》均获“海南省精品课程”。