敏性腹泻是人体的肠道内存在大量细菌、病毒和摄取的食物，即是外来的抗原。肠粘膜通过免疫性机制构成“粘膜屏障”，阻止抗原进入体内或控制机体对侵入抗原的免疫反应。如果这些粘膜屏障作用减弱或丧失，抗原便进入人的体内，激发人体产生主要为lge型的抗体，人体的肥大细胞和嗜碱粒细胞表面有高亲和力受体，能结合lge抗体，一旦暴露于相应抗原后，便引起不同类型的胃肠疾患的统称。
过敏性腹泻的症状在临床上主要表现为腹泻，大便可呈烂便，也可为暴发性水样泻，常带粘液和血。可早在2个月龄时出现症状，6个月至14岁患者可出现较严重全身症状，如湿疹、哮喘、过敏性鼻炎、贫血、发育营养障碍。