该军前身是直系军阀吴佩孚所属于学忠部。1926年，吴佩孚为加强长江防线的防御力量，抗击北伐军的进攻，任命于学忠为长江上游副司令、荆襄边防总司令。1927年初，国民革命军北伐进至长江沿岸，于学忠部战败后率部投降，被改编为国民革命军新编第九军，于学忠被任命为军长，下辖部队编制不详。该军组成不久后，于学忠以北伐北上为名，率部沿平汉路北上投靠奉军，后发展成东北军一部。