阜阳市审计局成立于1983年月12月。现有在职干部职工50人，内设办公室、综合科、人事教育科、监察室、机关党委、财政金融审计科、行政事业审计科、农业资金审计科、经贸审计科、基建外资审计科，经济责任审计局。

在市委、市政府和省审计厅的关心支持和正确领导下，坚持以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，认真贯彻党的十六届四中、五中全会精神和全市经济工作会议精神。以《宪法》、《审计法》等法律法规为依据，正确行使审计职能，维护财经法纪，开拓性地开展审计活动。 1996至2005年十年间，全市对6090个单位进行了审计，查出违纪违规金额335425万元，为财政增加收入10091万元。减少财政拨款或补贴1076万元,归还原渠道资金17550万元。局领导班子思路清，作风实，要求严，审计工作紧紧围绕经济工作中心，服务阜阳经济发展大局，改革管理机制，改善审计环境，改进工作方法，深入扎实地开展审计质量年活动，审计工作取得显著成绩。