福建中医药大学管理学院创办于2001年，同年开始招收公共事业管理（卫生管理方向）专业学生；2004年开设应用心理学（临床心理学方向）专业；2005年增设公共事业管理（医事法律方向）专业；2009年增设公共事业管理（信息管理方向）专业，同时将应用心理学（临床心理方向）改为中医学（临床心理学方向）专业。学校与台湾元培科技大学签订合作办学协议书，创办公共事业管理（卫生管理、健康管理方向）专业，计划于2010年开始招生。 学院设有10个教研室，分属于管理学、心理学、法学、马克思主义理论、外国语言学、计算机科学、公共艺术等学科，承担本院专业人才培养和全校性公共基础课的教学与科研任务。

学院专任教师76人，其中高级职称27人，中级职称33人，初级职称16人，教师梯队布局合理，平均年龄为38岁，可持续发展优势明显。近年来教师共发表论文117篇,学术专著5部，担任副主编和参编全国、省规划教材13部；中标科研课题42项，其中厅级以上课题14项、校管课题24项。专著《邓小平历史观研究》获得福建省第五届社会科学优秀成果三等奖。

学院拥有较为完善的教学基本设施，有心理学实验室、管理学基础实训室、模拟法庭示教室、多媒体语音室、计算机实验室等。设有教师教学图书资料室、师生阅览室，可满足教学和科研的需要。

建立健全学生见、实习基地，满足各专业课程的实践教学要求。除了学校附属医院、教学医院外，管理学院还与福州市卫生局、福州市第四医院、厦门市仙岳医院、泉州市第三医院、福建省煤矿中心医院、福建元一律师事务所、正方园司法鉴定中心、鼎力司法鉴定所、福建省榕城监狱心理调治中心以及惠好医药集团等单位签定共建协议；与福建省卫生厅、福建省疾病预防控制中心及福建省各市级卫生局、防疫站保持稳定的实习生实践教学的合作关系。