大理学院病原与媒介生物研究所成立于2006年4月，是大理学院基础医学院“病原生物学”学科的四个业务机构（媒介与病原生物研究室、微生物与免疫学教研室、病原生物学综合实验室和寄生虫学教研室）与云南省寄生虫病防治所联合组建的一个研究所。该研究所挂靠大理学院基础医学院，由两个部分组成，本部设在大理（大理学院基础医学院内），分部设在思茅（云南省寄生虫病防治所)。 大理学院病原与媒介生物研究所本部（大理）涵盖了医学微生物学、免疫学、寄生虫学和媒介生物学等分支学科，是云南省“十五”省级重点建设学科，其所依托的“病原生物学综合实验室”是云南省示范实验室。研究所本部目前有专业技术人员18人，其中教授4人，副教授及高级实验师2人，博士4人，留学归国人员2人。在现有专业技术人员中，有云南省学术带头人1人、云南省有突出贡献的专业技术人员1人、云南省优秀教师1人、云南省教学科研带头人1人、校级学术带头人5人，近年主持各类科研课题30余项（包括7项国家自然科学基金和7项云南省自然科学基金课题），科研经费200多万元，所主持的项目先后获省、厅级科技成果奖6次（包括云南省科学技术贰等奖1次和云南自然科学叁等奖1次）和校级教学成果奖多次，出版学术书籍和教材10余本，在国内外发表学术论文200余篇（其中英文20余篇），部分文章被SCI收录。

大理学院病原与媒介生物研究所思茅分部（云南省寄生虫病防治所）现有专业技术人员70人，其中正高级职称3人，副高级职称11人，硕士6人，留学归国人员6人。1997年以来主持国际合作课题5项，主持省（部）级科研课题7项，参与省（部）级课题4项，主持地（厅）级课题12项，获课题经费（折合人民币）300余万元（含15万美元的国际合作项目），1983年以来所主持的科研课题获各种科技成果奖共28项，其中云南省科技进步三等奖18项，卫生部科技成果三等奖1项，云南省卫生厅等地（厅）级科技成果奖9项，出版著作2本，在国内外学术刊物发表研究论文300余篇。

大理学院病原与媒介生物研究所设有“病原生物学”硕士授权点一个，有 “感染与免疫”、“临床病毒学”、“寄生虫感染与免疫”、“寄生虫病的诊断与防治”、“媒介生物学”和“虫媒传染病”等不同研究方向，每年招收研究生20名，热忱欢迎医学和生物学专业毕业生报考，欢迎海内外有识之士与我们一道开展合作研究。