北京二商科技研发中心是集团公司设立的既为支撑二商食品工业也为食品行业服务的食品科研机构。中心下辖三个法人机构：中国肉类食品综合研究中心、北京市食品研究所、北京市食品酿造研究所。

中心的研究开发工作涉及肉类食品、植物蛋白及淀粉、发酵调味品、营养保健及方便食品、果蔬加工和环境保护等。中心同时承担着“国家肉类加工工程技术研究中心”、“国家农产品加工技术研发体系——畜产品专业委员会主任委员单位”、“市场准入（QS）肉制品专业技术委员会主任委员单位”、“中国菌种保藏委员会工业微生物中心站酿造分站”、“中国调味品协会技术研究发展中心”的机构管理工作。三家研究机构承担了大量的国家、省部级科研项目，且一大批成果在行业中得以应用，对食品工业的科技进步起到了重要作用。

中心的食品安全、质量检验工作是以“一中心”，“三市站”的名义进行的，即“国家肉类食品质量监督检验中心”，“北京市食品质量监督检验二站”、“三站”、“茶叶站”。检验品种涉及肉类、蛋类、水产类、茶叶、饮料、调味品、豆制品、糕点、酱腌菜、香辛料、速冻食品、冷冻饮品等，具有理化检验，微生物检验和分子生物学检验的多种现代检验手段。同时承担着“全国食品工业标准化技术委员会肉类食品分技术委员会秘书处”的标准化工作。 中心还主办发行了《食品科学》、《中国酿造》、《中国食品》、《肉类研究》和《天下美食》五种期刊，而且《食品科学》和《中国酿造》是中文核心期刊。

中心拥有自己的科技产业。其中熟肉制品在政府的服务保障序列中是常年“特需供应”产品；得宝口服液更是肿瘤治疗的重要辅助产品。

中心设有培训部门，承担亚太地区肉类科技培训中心的管理工作，常年接受企业的定向委托培训，同时每年承担数批“南南合作”项目的国际培训，且拥有专门的“培训楼”。中心还设有“建设项目环境影响评价中心”，具有国家甲级评价资质和乙级设计资质。

中心现有职工289人，其中在职人员中享受国务院特殊津贴专家3人，教授级高工5人，高级职称31人，中级职称58人。并有硕士研究生53人，其中博士研究生4人。