珲春河大麻哈鱼国家级水产种质资源保护区总面积4375公顷，长度43.75公里，其中核心区面积为1094公顷，实验区面积为3281公顷。核心区特别保护期为4-10月。保护区位于吉林省珲春市境内图们江一级支流珲春河段，范围在东经130°15′00″-130°30′07″，北纬42°43′00″-43°50′08″之间，呈南北走向，保护区最大宽度1公里。核心区范围在东经130°27′15″-130°36′45″，北纬42°54′00″-42°58′30″；实验区范围在东经130°14′30″-130°29′45″，北纬42°43′40″-42°58′25″。主要保护对象为大麻哈鱼、日本七鳃鳗、滩头鱼，其他保护物种包括马苏大马哈鱼、驼背大马哈鱼、花羔红点鲑、细鳞鱼等。