石琪高1932年出生于福建省福清市，1938年随母亲来到了印度尼西亚，在那里度过了他的小学、初中和高中时光。并一直担任学校学生会主席。1952年，受新中国的号召，他作为领队的副团长随着724人的印度尼西亚回国升学团回到了祖国。

1978年之前，石琪高一直在基层劳动，78年后命运开始慢慢好转，到柳州第二建筑工程公司劳动，1982年被提为公司副经理，1983年，在中央关于领导干部要实现“四化”的政策指导之下，他被任命为柳州市人民政府市长。柳州在他的带领下开始了新一轮的腾飞，同时兼任广西工学院迁到柳州的第一任院长；到1988年，由于贪官的迫害，石琪高学长的命运又走入了低谷，被人诬陷了很多“莫须有”的罪名，险些被开除党籍，1990年他被撤销市长职务。直到2000年柳州的腐败问题得到有效整治后，石琪高被委任为柳州市经济和社会发展重大决策咨询委员会委员 、柳州市工商联闽籍商会的永远荣誉会长。