六合者，天地，东西南北四方，这是自然界方位的六合。在少林六合功中，人体自身的六合分内三合与外三合。内三合分别是：心与意合，意与气合，气与劲合。内三合是练功中的一种气血导引状态，以动作、意念、呼吸三者合而为一，使气血在经络中贯通。外三合分别是：肩与胯合，肘与膝合，手与脚合。外三合是练功时肩胯、肘膝、手脚与脏腑对应交叉相合的人体内外八卦的合。在人体经络中的六合分别是手三阴经与手三阳经相合，即手太阴与手阳明相合，手厥阴与手少阳相合，手少阴与手太阳相合。足三阴经与足三阳经相合，即足太阴与足阳明相合，足厥阴与足少阳相合，足少阴与足太阳相合。与此同时相对应的脏腑亦是表里相合，如肺与大肠相合，心包与三焦相合，心与小肠相合，肝与胆相合，脾与胃相合，肾与膀胱相合。

练习六合功追求的是天人相应。以人体关节、脏腑、经络、心意的六合与自然界方位相合，顺应大自然的变化。从关节合到脏腑、经络合再到心意合。六合功的效应是经络通气血畅，五脏六腑调和，亦是天人合一的阴阳平衡之道。