西汉元封五年（公元前106）置。治所清阳城（今河北省馆陶县路桥乡清阳城村）。先隶冀州巨鹿郡，后属魏郡，三国魏黄初二年（221）改隶阳平郡，西晋咸宁年间（275～280）改属司州阳平郡。十六国后赵建平元年（330），改清渊县为临清县，后省。北魏太和二十一年（497），复置清渊县，仍属司州阳平郡；同年，析清渊县西部地域复置临清县。北齐时，清渊县治改徙清水堡。隋开皇元年（581），清渊县改属清河郡。唐时，清渊县并入临清县。后不复置。