漓江光倒刺鲃金线鲃国家级水产种质资源保护区总面积为255.5公顷，其中核心区面积为50.0公顷，实验区面积为205.5公顷。核心区特别保护期为全年。保护区位于广西自治区桂林市的漓江，由漓江干流冠岩河段及支流桃花江河段两部分组成。核心区位于漓江干流的冠岩潭至浪洲潭河段，范围为（25°03′06.5″N，110°27′04.1″E）至（25°02′06.4″N， 110°26′58.5″E）。实验区分为三个区域：其一，自漓江黄牛甲12号航标灯塔至冠岩潭，范围为（25°06′34.7″N， 110°25′04.9″E）至（25°03′06.5″N，110°27′04.1″E）；其二，自漓江浪洲村码头至鸳鸯滩桃源村码头，范围为（25°02′06.4″N，110°26′58.5″E）至（25°01′31.5″N， 110°27′31.7″E）；其三，自桃花江上游北冲村至鲁家村滚水坝，范围为（25°18′35.0″N，110°16′33.2″E）至（25°17′52.6″N， 110°16′09.4″E）。主要保护对象为光倒刺鲃、金线鲃以及冠岩潭、浪洲潭2个鱼类越冬场，黄牛甲、社公滩、斗米滩、鸳鸯滩4个鱼类产卵场，其他保护物种包括漓江鳜、黄喉拟水龟、花鳗鲡、多瘤丽蚌、大鲵、长麦穗鱼等。