舰艇部门是舰艇直辖的一级组织，简称部门。分为战斗部门和勤务部门两类，在舰艇内部起到中间环节的作用。舰艇部门的设置和名称，根据担负的专业职能和掌管的武器、技术装备而定。不同类型舰艇的部门设置不尽一致。我军舰艇部门通常设置为航海、枪炮、反潜、观察通信、机电、情报电子战、导弹、航空等战斗部门以及舰务部门和军需、卫生、防化、译电专业。