MIPSX是由德国Max-Planck研究所创建的复合数据库(Mewes等，1998)。MIPSX由以下数据库整合而成：PIR、MIPS一级序列数据库（MIPSOwn）、MIPS/PIR一级序列数据库（PIRMOD）、MIPS一级翻译序列数据库（MIPSTrn）、MIPS酵母数据库（MIPSH）、NRL-3D、SWISS-PROT、EMTrans（由EMBL翻译得到的序列）、GBTrans（由GenBank翻译得到的序列）、Kabat和PseqIP。MIPSX数据库按照表3.2中所列的数据库顺序设置优先级，并将这些数据库中的重复序列删除，只保留一个相关条目。