碱性蛋白质 basic protein 一般是指等电点比通常的生理条件下偏碱的蛋白质。精蛋白或组蛋白为其代表例。

R基团在Ph7.0时带有正电荷的氨基酸。例如赖氨酸，精氨酸，和组氨酸。精氨酸带有正电荷的胍基，组氨酸带有弱碱性的咪唑基础，赖氨酸在其脂肪链上带有第二个氨基。