春秋时楚番邑，秦始皇二十六年(公元前221年) 置番县，县令吴芮始筑城池，县治在今鄱阳镇，属九江郡。西汉属豫章郡，因县城处番水（今鄱江）之北而改名番阳县。东汉改鄱阳县，属豫章郡。建安十五年（210年）属鄱阳郡，为郡治，县治迁至今古县渡镇。三国赤乌八年（245年）县治还至今鄱阳镇，晋咸宁六年（280年）三月迁治今石门街镇，南朝齐中兴二年（502年）还治今鄱阳镇。梁元帝承圣二年（553年），分江州立吴州领鄱阳郡，同治鄱阳县。陈至德四年（586年），以鄱阳郡还属江州。隋开皇九年（589年）废郡置饶州，治鄱阳县；隋大业三年（607年）复为鄱阳郡；唐高祖武德五年（622年）复为饶州，辖境相当今江西省鄱江、信江两流域（婺源、玉山两县除外）；玄宗天宝元年 (742年) 复为鄱阳郡；肃宗乾元元年 (758年)复为饶州，辖境缩小，仅限今鄱江流域及信江下游地区；元至元十四年（1277年）升为饶州路；元至正二十一年（1361年）改为鄱阳府，明洪武二年（1369年），改为饶州府；清沿用明制，治所均为鄱阳县。1912年废府属省。1914年属浔阳道。1926年复属省。1932年属江西省第四行政区。1935年属第五行政区。1952年属上饶专区。1957年改名波阳县。1971年属上饶地区。2000年撤地并市，鄱阳县隶上饶市管辖。2003年12月17日经民政部批准，波阳县恢复鄱阳县名。