恩滋药业（南京）有限公司成立于2006年2月28日，位于南京市新港经济技术开发区恒竞路28号。恩滋药业是由一个四人留学人员团队和三名投资人共同创立，旨在中国建立一个可同时运用化学和生物的综合平台发展绿色化学和手性技术的高科技生物公司。

经过两年多的发展，恩滋药业拥有四家子公司，成为一个集研究开发、工业放大以及化学贸易为一体的公司，总共拥有员工近40人。同时，恩滋药业拥有多项专利技术，并在手性药物以及手性化学品的合成，尤其是酶法合成方面，处于国内领先地位。

2008年底，恩滋药业（南京）有限公司迁往苏州。