衢州市中心血站于1998年7月正式独立建制，是衢州市卫生局直属的公益性事业单位。其主要工作职责是，按照省级人民政府卫生行政部门的要求，在规定范围内开展无偿献血者的招募、血液的采集与制备、临床用血供应以及医疗用血的业务指导等工作；承担供血区域范围内血液储存的质量控制；对所在行政区域内的中心血库进行质量控制；承担卫生行政部门交办的任务；承担衢州市献血工作领导小组办公室工作职责，负责全市无偿献血工作的组织发动、宣传和招募；负责临床科学合理用血指导和监督。　市中心血站座落在柯城区荷花东路252号，占地面积6亩，业务用房3090平方米。业务大楼是2001年国债投资血站建设项目，同时也是2002年衢州市政府为民办实事项目之一。现有工作人员38人，其中，卫生专业技术人员占73%，具中级职称以上的有24%。按国家标准开展各项血液检测，为医疗机构提供全血、红细胞、洗涤红细胞、新鲜冰冻血浆、冷沉淀、机采血小板等各种血液成分。现年采供血量6吨左右。

市中心血站一直坚持以“重视血液质量，文明优质服务，强化内部管理”为办站方针，将ISO9000管理理念引入血站质量管理体系，建立完善了覆盖全站各岗位的质量管理体系，使血站步入管理科学化、采供血标准化、服务规范化、成分血制备科技化的轨道。自1998年10月1日《中华人民共和国献血法》实施以来，中心血站认真贯彻执行，在衢州市委市政府高度重视和社会各界的大力支持和协助下，通过10年努力，使我市无偿献血工作取得了阶段性成果，无偿献血制度在我市已基本落实。从2002年起，全市临床用血100%来自无偿献血。建站10年来，未发生经输血传播的疾病，有力地保证了输血安全。

市中心血站几年中先后被授予浙江省无偿献血促进奖单位、省级卫生先进单位、市级文明单位；连续3年被评为卫生系统先进单位；两个外采组分别被全国妇联和团省委授予“巾帼文明岗”、“青年文明号”。