资兴市疾病预防控制中心原为资兴县卫生防疫站，始建于1956年8月。1984年12月经国务院批准，资兴县撤县改市，机构遂更名为资兴市防疫站。1991年经资兴市编制委员会批准，升格为副科级全额事业单位。2002年7月撤销资兴市卫生防疫站，组建资兴市卫生监督所和资兴市疾病预防控制中心。

四十多年来，在党和政府“预防为主”的卫生工作方针指引下，中心的卫生防疫事业蓬勃发展。通过全体卫生防疫工作者和乡镇卫生人员坚持不懈的积极努力，全面实施和落实了各项卫生防疫措施，并取得了非常显著的防治效果。经国家卫生部和省卫生厅考核验收，实现了消灭丝虫病和基本消灭疟疾，基本控制碘缺乏病的目标。从1983年起，脊髓灰质炎、白喉已无病例报告，百日咳、麻疹、流脑、乙脑等急性传染病亦有效控制在国家规定标准以内。到1997年底全市乙、丙类传染病总发病率为118.10/10万，受到了各级党和政府领导的好评，为资兴市人民的健康和社会经济发展作出了应有的贡献。

新组建的资兴市疾病预防控制中心核定全额拨款地方事业编制36名，内设办公室、财务科、疾病控制科、结核病防治科、检验科和卫生监测科等6个职能科室，将成为全市疾病预防控制的业务技术指导中心。