上海市理教分会是由上海理教联合会改组而成，成立于民国25年10月，分会主席张一尘。会址设在闸北宝山路升顺里13号，所属理教公所79所。

民国26年，上海市理教分会在闸北的会址，在八一三事变中毁于日本侵略军炮火后，会址迁到租界临时办公。

上海沦陷后，上海市理教分会主席张一尘公开投敌。民国29年2月，该会又向汪伪社会民众运动指导委员会上海分会及伪上海特别市社会局、警察局备案，改名上海市理教会，会址从租界迁到南市福佑路石皮弄，会长张一尘，所属理教公所有115所。

抗日战争胜利以后，中华理教总会于民国35年7月在南京恢复。不久，上海市理教会经过整顿恢复为上海市理教分会，主席徐伟如。会址设在复兴东路734弄4号，所属理教公所有135所。

1949年10月中华人民共和国成立后，上海市理教分会改称为上海市理教会，公所达167所。1951年后纷纷停办，至1963年10月已不到10所，上海市理教会因此自行解散。