中国水产科学院长江鱼类保护研究中心成立于2008年6月，位于江苏省江阴市。该中心总投资达1500万元，将成为我国长江中下游珍稀鱼类保护开发的重要科研基地。

中心由江阴市申港三鲜养殖公司和中国水产科学院淡水渔业研究中心联合建立，坐落于河豚渔村，占地20亩，总投资1500万元，中心将集科研、科普、交流、培训推广于一体。分别建有科研区，包括种质资源与生态实验室、生物学与鱼类生理实验室、水文与水化学实验室、浮游生物与饵料生物培养室、分析检测与显微摄影室；科普成果展示区设有长江鱼类活体展示室、标本室、科技成果室；学术交流与培训区建有200席的培训学术交流大厅及中小会议室。以及渔业信息区等六大区域。中心建成后，将成为我国长江中下游珍稀鱼类保护开发的重要科研基地，推动长江渔业的可持续发展。