中国交通运输部科技司隶属于中国交通运输，是其下辖的一个司局单位，正厅级。
1.组织拟订公路、水路行业科技、教育和信息化政策；拟订公路、水路行业科技和教育发展规划，并监督实施。
2.承担标准化管理有关工作；负责公路、水路有关国家标准、行业标准的相关管理工作；负责民航国家标准的相关管理工作；承担涉及综合运输体系的标准协调工作。
3.指导公路、水路行业科技创新体系建设；组织协调公路、水路有关国家级、部级科技项目研究；组织拟订有关部级科技项目计划并组织实施，指导行业科技成果转化和推广应用工作。
4.承担公路、水路行业产品质量和计量管理工作。
5.指导公路、水路行业信息化管理工作；负责部机关信息化工作。
6.指导公路、水路行业有关学科专业建设、职业教育和培训工作。
7.承办部领导交办的其他工作。
关于进一步规范交通运输部《科学技术成果鉴定证书》办理工作的通知
关于印发交通运输部科技项目管理办法的通知
关于印发公路水路交通信息化标准建设方案（2007－2010年）的通知
关于印发交通部软科学研究项目管理实施细则的通知
关于印发公路水路信息资源目录体系总体框架的通知
关于印发交通标准化工作规则的通知
关于印发交通视频会议系统管理办法的通知
关于印发《“十一五”交通教育与培训发展规划》的通知
关于加强交通信息资源开发利用的指导意见
财政部、交通部关于印发《西部交通建设科技经费管理暂行办法》的通知
关于转发《关于印发〈关于加强强制性标准管理的若干规定〉的通知》的通知
关于印发《西部交通建设科技项目管理暂行办法》和《西部交通建设科技》
关于印发《公路、水路交通信息化工作指导意见》的通知