元官署名。元世祖至元二十六年（1289年）置。掌也里可温教（基督教）事务，管理教士及十字寺（教堂）。延祐二年（1315年），改为崇福院，归并所属全国也里可温掌教司七十二所，全部事务均归崇福院管理。七年，复改为崇福司。有司使、同知、副使、司丞等官。