申元军（1915.12—2001.10），陕西米脂人。

1934年2月参加中国工农红军。

1936年2月加入中国共产党。

历任司务长、副科长、主任，华东野战军第12纵队后勤部副部长，第三野战军第30军后勤部副部长，华东军区海军后勤部副部长。

中华人民共和国成立后，任华东军区海军后勤部副部长，海军东海舰队后勤部副部长、部长，海军上海基地副司令员。

正军职离休干部。

2001年10月20日在上海逝世，享年86岁。

1955年9月被授予海军上校军衔.

1961年晋升为海军大校军衔。荣获三级八一勋章、二级独立自由勋章、二级解放勋章。

1988年7月被中央军委授予中国人民解放军二级红星功勋荣誉章。