上海崧泽遗址博物馆位于上海市青浦区赵巷镇崧泽村，总用地约1.3万平方米，总建筑面积3680平方米。上海崧泽遗址博物馆定位为“遗址保护管理、出土文物收藏、学术研究、乡土史教育及文化休闲旅游”，将成为遗址保护、考古研究、文物收藏的平台，了解上海乡土历史的场所。上海崧泽遗址博物馆建筑设计方案主题为“历史的剪影、聚居的村落”，充分体现了“现代风格、传统底蕴、原始符号”的遗址博物馆特点。设计方案将高低错落、体量各异的建筑叠合交错，将崧泽文化的悠久韵味固化为富于变化和充满灵动的造型，将对远古文化的感悟融入到建筑的形态中。建筑整体形态简朴庄重，犹如古老村落的缩影，契合江南水乡的人文地貌及水系纵横的自然地貌，以小桥、流水、村落和庭院的组合将现代与历史定格在遗址博物馆中，赋予博物馆浓郁的地域特色与人文气息。上海崧泽遗址博物馆将于2013年建成开放。

上海崧泽遗址是上海远古文化的发源地。1961年崧泽遗址的考古发掘改写了上海历史，大量珍稀文物将上海古代史前推至6000年前，再现了上海先民创造的灿烂文化，见证了上海这座城市悠久的文脉与传承，表明了6000年前的上海与当下现代大都市的上海同样辉煌。上海崧泽遗址既埋藏着6000年前最早的上海，又堆积有5000年前中国文明起源的证据，被评为“20世纪全国百项重大考古发现”之一。崧泽文化也成为第一个以上海地名命名的考古学文化。