上海医学科技奖经上海市政府科技主管部门批准，由上海市医学会设立，旨在表彰奖励在医学领域科技进步中做出贡献的优秀个人和集体，促进上海医学科技事业的发展。

2002年12月全面启动后，得到了全市广大医学科技工作者及卫生行政部门的大力支持，上海医学科技奖在上海医药卫生行业中的权威性正在不断提高。

为了更好地推动科技成果的推广应用和转化，为了鼓励、引导广大医务工作者积极开展社区卫生方面的工作，在深化医药卫生体制改革和促进卫生事业发展方面发挥更大的作用，根据广大医学科技工作者、全市各级医疗卫生机构和有关方面的反映和要求，上海医学科技奖从第八届开始增设“上海医学科技奖（成果推广）”和“上海医学科技奖（社区卫生）”两个奖项。