上海水产大学高等职业技术学院是上海水产大学为适应高等教育体制改革和社会发展需要而建立的两级学院。学院由上海水产大学、上海水产（集团）总公司、上海水产学校联合办学，发挥合作各方资源优势，实现“产学结合”。学院培养适应生产、建设、管理、服务第一线需要的高等技术应用性人才。

学校高职今年招收六个专业：仪器工艺（理工）、水产养殖（理工）、制冷与空调技术（理工）、运输动力机械管理（理工）、计算机技术与应用（理工）、文秘（文科），共计招收本市高中毕业生210名，三校生140名，学制均为三年制。

上海水产大学高等职业技术学院的办学地点设在民星路435号上海水产学校内。办学过程中衽上海水产大学和上海水产学校的教学资源及其他资源共享。