上海高校比较语言学E-研究院，是上海市教委领导的科研创新计划之一。

研究院的特点之一，是通过网络系统组织国内外比较语言学的著名学者，建设东亚比较语言学的研究基地。例如，首席研究员潘悟云教授，上海社联副主席，《中国语文》、《民族语文》、《语言研究》、《语言科学》编委，《东方语言学》主编，在汉语历史音韵学、汉语方言学、东亚语言比较、语料计算机处理等方面，在国内外享有很高的声誉。在特聘研究员中，陆丙甫，是新时期汉语语法研究的重要代表性学者之一，是目前国内类型学的领军人物。江荻，中国民族语言学会副会长，教育部民族语言标准化分技术委员会委员，《中文信息学报》编委，《民族语文》编委，曾获李方桂语言学奖、王力语言学奖和中国社会科学院部委优秀成果奖。吴福祥，中国社科院语言研究所研究员，是国内语法化研究的领军人物。蓝庆元是社科院民族学与人类学研究所的侗台语研究领导人。赵明鸣是社科院民族学与人类学研究所的突厥语研究领导人。张维佳在西北官话研究与地理语言学方面研究卓越，曾获王力语言学奖。张谊生，上海师大博导，在虚词与汉语语法研究方面在国内外卓有影响。

研究院的特点之二，是研究的前沿性。在许多方面的研究领域处于国内外领先地位。

在东亚语言历史比较中，汉语上古音研究一直是核心内容，潘悟云教授的汉语上古音系统，被国际汉学界称作Zhengzhang-Pan System，它与欧美的Baxter-Sagart system，在国际上具有最大的影响力，对东亚地区语言的历史比较起着重要的推动作用。他的《汉语历史音韵学》出版以后，在国内立即引起轰动性的讨论。在国际上也立即引起反响，康奈尔大学亚洲研究系前主任梅祖麟在香港语言学年会上的中心报告指出此书代表了中国音韵学的主流。欧洲最大的汉语史国际研究项目Thesaurus Linguae Sericae决定采用这个系统，并邀请潘悟云于2003年4月与2005年1-3月两次到欧洲进行宣讲。

语法化研究是近年来中国语言学的另一个热点。特聘研究员吴福祥是国内最早从事语法化研究的学者之一。近五年来他发起并主持召开了三届汉语语法化问题国际学术研讨会，主编了三本汉语语法化研究的论文集。他与另一位特聘研究员张谊生，为语法化理论的发展，作出不可忽视的贡献。

研究院的特点之三，是跨学科、跨语言、跨地区的研究。

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