日本鼠耳蝠（学名：Myotis macrodactylus）为蝙蝠科鼠耳蝠属的动物。在中国大陆，分布于中国（南部）等地。该物种的模式产地在日本。
^ 1.0 1.1 中国科学院动物研究所. 日本鼠耳蝠. 《中国动物物种编目数据库》. 中国科学院微生物研究所 [2009-3-27].
界： 动物界 Animalia
门： 脊索动物门 Chordata
纲： 哺乳纲 Mammalia
目： 翼手目 Chiroptera
科： 蝙蝠科 Vespertilionidae
属： 鼠耳蝠属 Myotis
种： 日本鼠耳蝠 M. macrodactylus