1994年8月31日，经黔西南州机构编制委员会批准，黔西南州地方税务局成立，为州政府机构，内设办公室、税政一科（分管所得税）、税政二科（其他税）、征收管理科、计划会计科、政工科等6个科室和两个直属单位（州直属分局、州稽查局），下辖8个县市地方税务局。1998年经省政府批准，地税局实行省局垂直管理，黔西南州地方税务局实行双重领导，同时对内设机构进行了调整，内设办公室、政策法规科、所得税管理科、地方税管理科、征收管理科、计划财务科、人事教育科、监察室、涉外税收管理分局、机关党办、信息中心等11个科室和两个直属机构（州直属征收分局、州地方税务局稽查局），下辖九个县市区地方税务局。