祁门县人民检察院成立于1951年7月，原称祁门县人民检察署，1954年12月，更名为祁门县人民检察院，“文化大革命”期间，检察机构被撤销，1978年7月恢复重建。现办公大楼位于安徽省黄山市祁门县阊林路，建筑面积2600平方米，新建于2002年元月，2003年11月迁入新办公楼。内设13个科、室、处、局。全院现有干警39人，其中检察长1人，副检察长3人，党组班子成员6人，党员30人，本科学历28人。

近年来，本院在黄山市人民检察院和中共祁门县委的领导下，在县人大的监督下和县政府、政协以及广大人民群众的关心、支持下，牢固树立“立检为民、执法为民”的执法理念，自觉践行“强化法律监督，维护公平正义”的工作主题，各项检察业务工作、队伍和基础建设取得了令人瞩目的成绩。2000年来先后被安徽省人民检察院授予“基层建设五好检察院”，被黄山市委、市政府授予“文明单位”，被祁门县委、县政府授予“平安单位”、“2001-2005年全县依法治县和法制宣传教育先进集体”等荣誉称号。