南京市栖霞区档案馆成立于1981年8月，隶属区委办公室。1984年5月，栖霞区档案局成立，与区档案馆合署。是区政府直属的科学文化事业机构，是全区永久保存档案的基地和利用档案的中心，主要任务是集中统一管理全区机关各部门、乡镇、区属企事业单位档案，开展档案提供利用工作，汇编档案史料，参与编史修志工作。履行全区档案事业行政管理和档案保管与开发利用职能。局（馆）内设综合管理、监督指导和保管利用三个科。局馆人员定编12名，依照公务员管理。其中：局（馆）长1名，副局（馆）长2名，正副科长3名。2003年被认定为区级爱国主义教育基地。2007年6月晋升为江苏省特二级档案馆，2008年7月晋升为国家二级档案馆。 2003年区档案馆综合楼建成并启用，总面积5000平方米，内设目录室、阅档室、编研室、陈列室、多功能厅、开放档案和现行文件服务中心、区爱国主义教育基地等场所。本馆现藏档案资料主要有文书、专门、科技以及声像档案。文书档案主要是区机关各部门、临时机构、区属企事业单位以及（乡、镇）街道工作中形成的计划、总结、通知、报表等文件材料；专门档案主要有婚姻、公证、城建、土地房产、计划生育、审计、会计、统计、普查等内容。截止2009年底，馆藏全宗已达108个，累计馆藏档案8万多卷，文件目录数据98万条，全文数字化97万页,照片档案15079张，光盘174张，各类图书资料2100余册，馆藏档案全部实现了计算机检索。