农业内源性污染，是指农业生产和农村生活自身造成的污染，主要包括化肥污染、农药残留对农产品的污染、农用塑料的影响、畜禽养殖业造成的污染。与之相应的是农业外源性污染，主要是工业和城市中形成的污染物对农业生产条件造成的污染；例如酸雨对农田土壤和农作物造成危害；二氧化硫、氟化物、粉尘等污染物给粮食、蔬菜、水果、茶叶、桑蚕等都带来损失；工业企业和城市污水肆意排入地表水；使用污水灌溉农田，造成土壤板结、作物品质降低；重金属污染严重；城市生活和工业生产排放的大量固体废物占用大片的土地，而且造成农田和地下水污染。