元成宗元贞元年（1295年），升宁都县为州，辖石城县，属赣州路。明太祖洪武2年（1369年），改赣州路为府，改宁都州为宁都县，9年（1376年），宁都县属江西布政使司赣州府。清初沿明制，高宗乾隆19年（1754年），升宁都县为直隶州。州治宁都（在今江西省宁都县城）。清末辖：石城（今江西省石城县）、瑞金（今江西省瑞金市）共2县。1913年废。