词条 | 能源微生物功能基因组的整合分析数据库 |
释义 | 本数据库系统是中国科学院青岛生物能源与过程研究所为解决工业化利用能源微生物作为可再生生物质能源资源所面临的科学问题,针对微藻等能源生物,而建立的一个允许协同分析与注释,整合基因组、转录物组、蛋白组、代谢物组、相互作用组学等功能基因组学数据的信息系统。自2009年10月开始上线服务。本数据库系统包含基因与转录物信息平台和蛋白质与代谢物信息平台两个子库。基因与转录物信息平台中的基因数据来源于青岛生物能源与过程研究所生物资源中心基因测序原始数据,以及基因序列分析过程中产生的中间数据,目前已收录一个物种(Nannochloropsis)的部分原始基因测序数据,约300GB;蛋白质与代谢物信息平台中的代谢物数据来源于中国科学院青岛生物能源与过程研究所代谢物组学团队通过实验所获得的各类标准谱数据,以及对其他数据库中的信息二次加工所获得的数据,约收集了超过2万个小分子代谢物信息,包括别名,化学结构,涉及的生物学物种和代谢途径等。 |
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